La tercera temporada comenzó el 25 de septiembre de 2008 y tuvo un total de 24 episodios finalizando el 21 de mayo de 2009. El argumento en esta temporada se basa en la decisión de Betty de mudarse a Manhattan, su deseo de ascender y su decisión de no tener más líos amorosos, deseos que pronto se ven frustrados ya que Ignacio sufre un ataque al corazón y Betty pronto se ve envuelta en un efímero enamoramiento con su vecino Jesse y posteriormente su naciente amor por Matt un compañero de YETI un programa de Entrenamiento Para Jóvenes Editores que marca también una nueva etapa en su relación con Marc quien también toma el programa. Su relación con Amanda también cambia drásticamente cuando Betty decide ayudarla dándole albergue en su nuevo apartamento.

Esta temporada muestra un cambio y madurez no solo en la vida de Betty sino también en la de Daniel, quien ahora desea establecerse y forma una familia. Daniel pronto se ve envuelto en un dilema ya que se enamora de Molly la prometida de Connor Owens un antiguo amigo de la universidad a quien deja a cargo de las finanzas de Mode. Connor pronto provoca una serie de sucesos inesperados despertando suspiros en Wilhelmina quien se encuentra en la espera del nacimiento su hijo quien se vio amenazado por una crisis de Alexis en la cual lanzo a Christina por las escaleras lo cual le costó su parte del imperio Meade para obtener su libertad y su posterior salida junto con su hijo a Francia. Wilhemina gana el corazón de Connor cuando Molly termina su relación porque pronto se ve enamorada de Daniel.

Pero la relación de Wilhelmina con Connor y su estabilidad emocional como la ahora Editora en Jefe (junto con Daniel) se ve amenazada por una decisión que toma Connor que deja la compañía al borde de la quiebra y la verdadera identidad de su recién nacido hijo. Daniel sin embargo ahora desea formar una familia junto con Molly, pero pronto su felicidad se ve también amenazada, no solo por la quiebra de la compañía y sus intentos por salvarla sino también por que Molly tiene cáncer y pronto morirá.

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